標準菌種亦稱模式菌株。在給某細菌定名，分類作記載和發表時，為了使定名準確和作為分類概念的準則，以純粹活菌（可繁殖）狀態所保存的菌種。相當于動植物分類中的模式標本。在進行細菌等的分類和鑒定時，生理學和生物化學特性十分重要，但若就這些性質進行試驗，就必須應用許多純分離的新細胞。
標準菌種的復壯：
1、在無菌環境下撕開袋子取出KWIK-STIK。
2、撕開pull-tab的一部分并用標簽系住原培養菌皿。
3、捏住針劑的底部讓水合物流出。
4、垂直的握住針劑使小球滑到底部。
5、捏碎小球使里面的液體充分混合。
6、立即把棉簽浸泡在液體中。
7、在接種培養皿中，轉動棉簽作直徑大概25mm的圓周運動。
8、用已經消過毒的環在接種區域迅速劃線，使其被分離出來。
9、正確的處理用完的藥簽，防止污染。
10、立即培養被分離出來的菌株。
標準菌種的取樣流程：
1、在取樣之前應確認貨、證是否相符.
2、取樣過程中應避免與水等環境的不良因素影響,防止樣品被污染.
3、取樣用具(如注射器、采血管、試管、探子、鏟子、匙、取樣器、剪子、樣品袋等)必須是經過滅菌的.
4、對采集的樣品一般要求隨機取樣.若懷疑有可能受病原體污染或者帶病原體的樣品,可以進行選擇取樣.
5、根據樣品種類(如盒裝、袋裝、瓶裝和罐裝),應取完整密封的樣品.如果樣品很大,則需用無菌取樣器取樣;若樣品是粉末,應邊取邊混合;若樣品是液體的,通過振搖即可混勻;若樣品是冷凍的,應保持冷凍狀態(可放在冰內、冰箱的冷盒內或低溫冰箱內保存),而非冷凍動物產品須保持在0℃~5℃中保存.
6、取樣前或取樣后應在盛裝樣品的容器或樣品袋上立即貼上標簽,每件樣品必須標記清除(包括品名、來源、數量、取樣地點、取樣人及取樣日期).
7、獲取有關取樣產品的信息:如樣品名稱、批量大小、包裝類型、包裝容器體積、生產線、產品編號或控制號、批量號、標簽內容、包裝破損狀況、產品存放地點或建筑物的基本情況等.
8、當客戶對所規定的取樣程序有偏離、添加或刪節的要求時,應詳細記錄這些要求和相關的取樣資料,并記入包含檢測結果的所有文件中,同時告知相關人員.
9、當取樣作為檢測一部分時,實驗室應有程序記錄與取樣有關的資料和操作.這些紀錄應包括所用的取樣程序、取樣人的識別、環境條件(如果相關)、必要時有抽樣地點的圖示或其他等效方法,如果合適,還應包括取樣程序所依據的統計方法。
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